Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg4bQ8BGE6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms