Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htatsf1Q8BGC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms