Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG17

Nol12, Nucleolar protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol12Q8BG17 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol12Q8BG17 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol12Q8BG17 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms