Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChfrQ810L3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms