Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5bQ80Y84 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm5bQ80Y84 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms