Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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Npm2Q80W85 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
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Npm2Q80W85 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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Npm2Q80W85 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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Npm2Q80W85 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
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Npm2Q80W85 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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