Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms