Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NischQ80TM9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
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