Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdc42bpbQ7TT50 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms