Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim17Q7TPM3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim17Q7TPM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms