Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrc2bQ7TPM1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms