Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms