Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNR9

Arhgef4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef4Q7TNR9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Arhgef4Q7TNR9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef4Q7TNR9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef4Q7TNR9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms