Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim46Q7TNM2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms