Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shq1Q7TMX5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms