Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim12Q78RX3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms