Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snd1Q78PY7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snd1Q78PY7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms