Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msrb2Q78J03 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms