Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms