Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Syne1Q6ZWR6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms