Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ncapd3Q6ZQK0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms