Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nemp1Q6ZQE4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms