Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ino80Q6ZPV2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80Q6ZPV2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms