Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timd4Q6U7R4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timd4Q6U7R4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms