Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc4Q6S5L9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shc4Q6S5L9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms