Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ptx4Q6RUU0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms