Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CenpeQ6RT24 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CenpeQ6RT24 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms