Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf4Q6PFF0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms