Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dtx4Q6PDK8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms