Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbtb40Q6PCS8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms