Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gapvd1Q6PAR5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms