Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms