Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5416Q6IE28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gm5416Q6IE28 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5416Q6IE28 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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