Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms