Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rftn1Q6A0D4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rftn1Q6A0D4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms