Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cep170Q6A065 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms