Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd6Q69ZL1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd6Q69ZL1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms