Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg9aQ68FE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9aQ68FE2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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