Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp9bQ66X22 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp9bQ66X22 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms