Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lcn3Q62471 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lcn3Q62471 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms