Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Supt6hQ62383 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Supt6hQ62383 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt6hQ62383 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms