Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf6Q62311 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms