Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sptbn1Q62261 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sptbn1Q62261 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sptbn1Q62261 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sptbn1Q62261 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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