Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55bQ61476 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd55bQ61476 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms