Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms