Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hcfc1Q61191 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hcfc1Q61191 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hcfc1Q61191 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcfc1Q61191 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcfc1Q61191 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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