Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
OclnQ61146 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OclnQ61146 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms