Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp4Q60972 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp4Q60972 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms