Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Laptm4aQ60961 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms