Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms